Difference between revisions of "User:Macn04"
(Created page with "= Simulace: Šíření houby Ophiocordyceps mezi mravenci = V rámci této práce jsem vytvořila simulační model, který zkoumá dynamiku šíření houby Ophiocordyceps un...") |
|||
| Line 9: | Line 9: | ||
= Popis modelu = | = Popis modelu = | ||
| − | == Agenti: mravenci == | + | === Agenti: mravenci === |
| − | === Stav/state === | + | ==== Stav/state ==== |
healthy, infected, dead, carried (zabitý jiným mravencem v rámci obrany kolonie) | healthy, infected, dead, carried (zabitý jiným mravencem v rámci obrany kolonie) | ||
| + | ==== Parametry ==== | ||
| + | infection-time (čas, kdy došlo k nákaze), fungus-growth-timer (čas růstu houby po smrti), target-patch (cíl pro fázi "death grip") | ||
| + | === Plocha/patches === | ||
| + | * '''nest?''': identifikátor hnízda | ||
| + | * '''spore-timer''': délka infekčnosti po úmrtí mravence | ||
| + | * '''strange-pheromone''': síla feromonu u infikovaných mravenců | ||
| + | === Visualizace === | ||
| + | * Feromon je zobrazován jako odstín fialové (scale-color magenta). | ||
| + | * Spory jsou reprezentovány červenými patchemi. | ||
| + | * Mraveniště je hnědé. | ||
| + | * Zdraví mravenci černí, infikovaní černí/červení, mrtví šedí nebo bílí. | ||
| + | === Parametry na sliderech === | ||
| + | • '''infection-chance''': pravděpodobnost nakažení | ||
| + | • '''incubation-period''': doba inkubace houby | ||
| + | • '''fungus-growth-time''': doba růstu houby po smrti | ||
| + | • '''spore-lifetime''': jak dlouho vydrží spory infekční | ||
| + | • '''pheromone-decay-val''': rychlost rozptylu feromonu | ||
| + | • '''population-growth-rate:''' procentuální denní přírůstek z počtu zdravých mravenců | ||
| + | • '''spore-radius''': dosah spor při plném růstu houby | ||
| + | • '''aggression-mode''': ''0'' (otupělí mravenci = nereagují na feromony, ani na infekční oblasti), ''1'' (snaží se infikovaným mravencům a místům vyhýbat), ''2'' (po detekci zabíjejí infikované jedince) | ||
| + | |||
= Výsledky = | = Výsledky = | ||
Revision as of 22:14, 15 June 2025
Contents
Simulace: Šíření houby Ophiocordyceps mezi mravenci
V rámci této práce jsem vytvořila simulační model, který zkoumá dynamiku šíření houby Ophiocordyceps unilateralis v mravenčích koloniích. Cílem simulace je získat poznatky o tom, jak parazit manipuluje hostitelem a jaké faktory ovlivňují rychlost a rozsah infekce. Model je navržen v prostředí NetLogo a umožňuje testovat různé scénáře šíření infekce a analyzovat výsledky bez nutnosti experimentování s reálnými populacemi.
Definice problému
V práci zkoumám šíření houby Ophiocordyceps unilateralis, která je také přezdívána jako "zombie houba", která infikuje dělnické jedince, mění jejich chování a vyvolává tzv. "death grip". V jednoduchosti infikovaný mravenec je ovlivněn houbou tak, aby opustil mraveniště, zemřel v jeho okolí a umožňoval růst houby, která po dozrání vypustí spory a infikuje další jedince. Cílem simulace je kvantifikovat rychlost a rozsah šíření infekce v závislosti na klíčových parametrech, jako jsou velikost kolonie, pravděpodobnost přenosu a délka inkubační doby.
Metoda
Pro implementaci byla zvolena multiagentní platforma NetLogo, která umožňuje simulovat jednotlivé mravence jako nezávislé agenty a okolní prostředí jako patche.
Popis modelu
Agenti: mravenci
Stav/state
healthy, infected, dead, carried (zabitý jiným mravencem v rámci obrany kolonie)
Parametry
infection-time (čas, kdy došlo k nákaze), fungus-growth-timer (čas růstu houby po smrti), target-patch (cíl pro fázi "death grip")
Plocha/patches
- nest?: identifikátor hnízda
- spore-timer: délka infekčnosti po úmrtí mravence
- strange-pheromone: síla feromonu u infikovaných mravenců
Visualizace
- Feromon je zobrazován jako odstín fialové (scale-color magenta).
- Spory jsou reprezentovány červenými patchemi.
- Mraveniště je hnědé.
- Zdraví mravenci černí, infikovaní černí/červení, mrtví šedí nebo bílí.
Parametry na sliderech
• infection-chance: pravděpodobnost nakažení • incubation-period: doba inkubace houby • fungus-growth-time: doba růstu houby po smrti • spore-lifetime: jak dlouho vydrží spory infekční • pheromone-decay-val: rychlost rozptylu feromonu • population-growth-rate: procentuální denní přírůstek z počtu zdravých mravenců • spore-radius: dosah spor při plném růstu houby • aggression-mode: 0 (otupělí mravenci = nereagují na feromony, ani na infekční oblasti), 1 (snaží se infikovaným mravencům a místům vyhýbat), 2 (po detekci zabíjejí infikované jedince)
